紫云英是豫南稻区主要的冬季绿肥作物，现在正是紫云英病虫草害的高发时期，及时进行防治，是夺取紫云英高产的关键。
豫南稻区紫云英田的主要禾本科单子叶杂草有看麦娘、棒头草、罔草，双子叶杂草有牛繁缕、猪殃殃和荠菜。稻田套播的紫云英田杂草很少，一般不需要防治。草害严重发生的地块，应尽早防治。在杂草2叶1心期每亩用高效盖草能20毫升加水30公斤喷雾，可基本杀灭禾本科杂草，其它杂草可用人工拔除。
紫云英生长期间主要病害有菌核病、白粉病。开好排水沟，防止田间积水，降低田间湿度，可有效抑制病害的发生和传播。
紫云英菌核病发病时每亩用40％菌核净可湿性粉剂100～150克兑水75～100公斤喷雾，在早期也可每亩用70％甲基托布津可湿性粉剂50～100克，或用50％多菌灵可湿性粉剂50～100克兑水1000倍喷雾。
防治白粉病可每亩用20％三唑酮（粉锈宁）乳油5～10克兑水50公斤喷雾；或每亩用30％特富灵可湿性粉剂20～40克兑水70公斤喷雾，在发病初期或初病盛期喷雾，效果都很好。
主要虫害有蚜虫、蓟马和潜叶蝇。虫害可采用蚜虱净、比特灵、溴氰菊酯等农药防治，但这些农药在消灭虫害的同时，也杀死大量蜜蜂。在紫云英留种区，每亩可用25％抗蚜威20克兑水50公斤喷雾，既能杀死害虫，又能保护蜜蜂不受毒害。
